近日,第九届全国大学生生命科学竞赛(CULSC)全国总决赛落下帷幕。作为国家级A类竞赛,也是生命科学领域最具影响力的顶级赛事之一,本届竞赛汇聚了来自全国629所高校的16732个团队。
上海交通大学医学院附属新华医院泌尿外科团队“基于单细胞测序整合空间转录组测序构建PRAD肿瘤细胞分化命运相关的分子生物学分类系统”项目荣获第九届全国大学生生命科学竞赛(科学探究类)一等奖。本项目由新华医院泌尿外科崔心刚教授和潘秀武副研究员指导,新华医院泌尿外科博士生刘逸凡带队,上海交通大学医学院临床医学五年制本科学生陆炳楠(2019级),姚蕴韬(2020级),张浩宇(2021级),杨欣跃(2021级)和赵梓惠(2021级)实践,在三轮紧张激烈的比赛答辩层层筛选中脱颖而出,一路斩获“科学探究类”赛道上海交通大学校赛一等奖、上海市省赛一等奖、最终获得全国决赛一等奖!
前列腺腺癌(PRAD)是一种高度异质性的疾病,某些亚型与不良预后密切相关。因此,构建精准的PRAD分子分型系统,早期识别干预高危亚型对改善患者预后至关重要。本研究通过单细胞测序整合空间转录组分析,Monocle 2拟时分析,并结合TCGA数据库生存分析,识别了3种PRAD肿瘤细胞亚型及33个肿瘤细胞分化相关预后基因,据此构建了包含3种亚型的肿瘤细胞分化命运相关的PRAD分子生物学分类系统及各亚型的调控网络,并在回顾性临床队列中验证了该分型系统的预后预测价值。本研究发现COL1A1+MYLK+亚型是PRAD患者总生存率和无进展生存率的独立风险因素,且该亚型患者往往具有更高的Gleason分级,术前骨转移比例、术后进展比例更高,接受放疗、化疗、内分泌治疗的比例也更高。临床上可以开发包含各亚型标记基因抗体的诊断试剂盒,临床医生可以据此对PRAD进行精准的分子分型,早期识别高风险亚型并早期干预,从而改善患者的预后。
团队负责人
2019级临床医学五年制本科生/2024级新华医院泌尿外科崔心刚教授学硕陆炳楠
指导教师
崔心刚,上海交通大学医学院附属新华医院泌尿外科科室主任,主任医师,教授,博士生导师。中华医学会泌尿外科分会青委会副主任委员、中国中西医结合学会围手术期专业委员会副主任委员、中国医师协会内镜医师分会副总干事长、上海市中西医结合学会围手术期专业委员会主任委员等。主持国家自然科学基金重点项目等国家/省部级基金支持35项。入选上海市“医学领军人才”,上海市“优秀学术带头人”,上海医苑新星“杰出青年”。荣获教育部科技进步奖一等奖、上海市科技进步奖一等奖、华夏医学科技奖三等奖等学术荣誉。
潘秀武,上海交通大学医学院附属新华医院泌尿外科副主任医师,副研究员,硕士生导师。入选上海市科委“科技启明星计划”、上海市“医苑新星”优秀青年医学人才、上海交通大学“青年岗位能手”、上海交通大学医学院“九龙医学优秀青年人才奖”等人才计划。