上海交通大学医院战略管理研究所设置于上海交通大学医学院附属新华医院，是一个以医院管理科研为主、实证研究和实践相结合的医院管理专门研究机构。

研究所立足医院战略管理问题的剖析与破题，从聚焦维系公立医院公益性质、发挥公立医院骨干作用、完善公立医院资源配置、强化公立医院内部管理、提高公立医院运行绩效入手，进行转型背景下公立医院相关的“领导力与组织变革研究”、“法人治理结构研究”、“学科设置布局研究”、 “绩效评价研究” 、“服务流程整合研究”、“医院文化建设研究”、“医疗资源整合研究”等前沿性公立医院管理理论和实务的探索实践。

医院战略管理研究有研究人员18人，教授3人（并为博士生导师），其中所长徐卫国教授担任医学和管理学双学科博士生导师；获博士学位6人，博士生3人，研究所还与国外一些知名大学、研究机构建立长期联系，聘请部分海外学者、专家任客座教授。

成员研究成果丰富。承担“国家自然科学基金项目”、“上海市科委重大项目”、“上海市教委重点项目”、“上海市卫生局重点项目”等重要纵向课题，近3年在国内外重要核心期刊上发表论文30多篇、其中SCI论文2篇，并形成系列研究报告。

展望未来，医院战略管理研究所的目标是：通过组织、协调研究所内外医院管理专家资源，以医院战略管理研究所为平台，形成学术网络，成为较有影响力的研究机构，成为中国医院管理研究机构的中坚力量。